余甘子用种子繁殖，称为有性繁殖。通过性繁殖培育的苗木称为实生苗。往往实生苗结果较晚，是通过嫁接才能提前开花结果。实生苗繁殖一般是在春季，将采集的种子，按株行距20×30厘米，深3厘米的要求，将种子点播在苗床上。播完后将床面整平，稍加镇压，上盖山草或松针，并喷水使盖草和床面潮湿。播种后一般在20天左右，种子发芽，种苗逐渐出土，此时逐步揭去盖草，并随时保持苗床有一定的湿度。对床面的杂草要随时清除。待苗高40厘米时在阴天进行间苗，后喷灌清粪水一次，把间出的苗，带土移至另外苗床上种植。到苗高70-100厘米时，即可出圃进行移栽。 

余甘子的扦插繁殖，称为无性繁殖，培育的苗木叫做扦插苗。其方法是：在早春腋芽尚未萌动之前，在选好的母树上，剪取已经木质化的二年生枝条作为扦插条，将扦插条剪成15-20厘米，每一扦插条要保证有3-4个腋芽。将扦插条下部沾生根粉后在苗床上按株行距20厘米×30厘米，深5厘米斜插土中，千万不能将插条倒插。一般插后15天左右，地下部就会产生愈伤组织，形成根系，地上部的腋芽开始萌动。在苗高50-80厘米就可以出土移栽。扦插育苗，最好在塑料棚内进行，有利于保持土壤，空气的湿度和温度，克提高扦插苗的成活率。